Elle est constituée des 6 laboratoires de physique du petit plateau: FAST, ISMO, LAC, LPS, LPTMS, LuMIn. Le but de cette fédération est de former une structure légère de coordination scientifique et opérationnelle, ainsi d’être un élément d’animation de la physique sur le plateau du Moulon.
La FFJ repose sur un fort rapprochement géographique, puisque ces laboratoires se trouvent tous dans la même rue (rue du Belvédère), répartis sur une distance de seulement 800 m.
L’identité scientifique de cette fédération est l’étude expérimentale et théorique de la matière, qu’elle soit diluée (atomes, molécules, agrégats, plasmas) ou condensée (solides, liquides, granulaires, matière molle), ainsi que l’interaction de cette matière avec les rayonnements.